La Unidad de Análisis del EUNACOM es una unidad técnica encargada del soporte computacional y psicométrico del examen. Se encarga también de su corrección y puntuación. Depende directamente de la Dirección del EUNACOM y realiza estudios y análisis a solicitud del Director o del Consejo Estadístico.

Adicionalmente, como servicio a ASOFAMECH, se encarga de calcular la Calificación Médica Nacional (CMN), que consiste en una nota estandarizada de egreso que permite a los egresados postular con equidad a concursos nacionales.